Должен ли подрядчик, выполняющий работы по контракту, в случае его реорганизации предоставить заказчику новую банковскую гарантию, подтверждающую обеспечение исполнения контракта?

Нет, не обязан. Согласно статьям 368 и 370 Гражданского кодекса Российской Федерации, реорганизация подрядчика не влечет прекращения обязательств гаранта (банка) перед заказчиком. Таким образом, даже после реорганизации подрядчика банковская гарантия, выданная в обеспечение исполнения контракта, сохраняет свою силу.