Должен ли заказчик при заключении контракта на закупку товара, к которому применялись характеристики позиции КТРУ, указывать его наименование в контракте в соответствии с тем, как оно указано в КТРУ?

Да, заказчик должен указывать наименование и единицу измерения в соответствии с позицией КТРУ при заключении контракта, так как в соответствии с пп. «а» п. 2 Правил использования каталога товаров, работ, услуг для обеспечения государственных и муниципальных нужд (утв. ПП РФ от 08.02.2017 № 145) установлена обязанность заказчиков использовать информацию из КТРУ в целях установления наименования, единицы и описания товара, работы, услуги, в том числе в контракте, реестре контрактов, заключенных заказчиками.